辉骏生物RNA-pull down实验技术服务分以下两种:
1. RNA pull down WB,用于检测目标RNA与某样本中的待测蛋白是否存在相互作用;
2. RNA pull down MS,用于筛选目标RNA与某样本中的哪些蛋白具有相互作用。
RNA Pull down检测服务
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服务项目 | 服务内容 | 结果交付 | 实验周期 | 客户提供 | 价格
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RNA pull down WB | 制备RNA正义链和反义链探针 | 探针电泳图 | 5-6周 | 1、实验样本 2、含有目标基因序列的质粒模板及测序文件 3、待测蛋白抗体 4、实验信息表(样本信息、抗体信息、目标RNA和待测蛋白序列) |
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Western blot检测待测样本中的待测蛋白 | Western blot检测图 |
RNA pull down捕获目标RNA及其结合蛋白 (2组:正义链孵育组、反义链孵育组) | RNA pull down实验报告 |
Western blot检测RNA Pull down产物中的待测蛋白 | Western blot检测图 |
RNA pull down MS | 制备RNA正义链和反义链探针 | 探针电泳图 | 8-9周 | 1、实验样本 2、含有目标基因序列的质粒模板及测序文件 3、实验信息表(样本信息、目标RNA序列) |
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RNA pull down捕获目标RNA及其结合蛋白 (2组:正义链孵育组、反义链孵育组) | pull down实验报告 |
SDS-PAGE评估RNA pull down产物中的蛋白含量和数量 | SDS-PAGE银染检测图 |
LC-MS/MS定性检测pull down产物的蛋白、筛选实验组独有蛋白(潜在互作蛋白) | 质谱检索表格、互作蛋白筛选表格、检测报告 |
针对互作蛋白做生物信息学分析(GO、KEGG pathway、String) | 生物信息学分析结果和报告 | 1周 |
RNA pull-down服务优势*辉骏生物
十年服务经验,客户成果发表在Nature Methods,Oncogene,Cell Research等高水平期刊上。
对围绕RNA结合蛋白开展的整体课题提供全方位指导,包括上下游实验设计和结合蛋白的多方法验证等。
自有蛋白质组学平台,对RNA pull down产物这类微量蛋白的质谱鉴定有十足的把控能力,对后续的生物信息分析有独到的见解。
售后技术支持将一直保持到客户发表文章,确保客户安心进行下游实验及投稿。
RNA pulldown实验外包服务样本要求
1. 送样量要求
样本类型
| RNA pull down WB建议送样量 | RNA pull down MS建议送样量 |
动物细胞
| 3*10e7个细胞/组(约3个10cm皿) | 5*10e7个细胞/组(约5个10cm皿) |
动物组织 | 1g/组 | 2g/组 |
植物叶片 | 2g/组 | 4g/组 |
植物根或果实 | 4g/组 | 8g/组 |
菌体 | 50ul菌体沉淀/组 | 100ul菌体沉淀/组 |
▲注意:这里列出的均为每组样本的送样量,如果实验和对照组用的样本一致,此样本量*2。详细送样指南可联系辉骏生物客服或销售索取。
2. 样本保存和运输要求:
(1)样本用PBS清洗干净后,离心去掉液体,先放入液氮中速冻,再转移至-80℃冰箱中保存;
(2)样本一定要做好标记,应用油性防冻记号笔或标签纸在管上注明样本名称或编号;
(3)样本较多或需要分批做,要将样本分装;
(4)干冰取样/运输;需要至少在送样前一天通知我方。
RNA pull down实验结果示例

RNA pulldown WB:Western blot检测图(阳性)

RNA pull-down MS:SDS-PAGE银染检测图

RNA pull down-MS:质谱检索表格(部分展示)
RNA pull-down实验技术服务客户文章
